两者既有相同点也有不同点。
相同点:两者的生产基地(即环境)都没有遭到破坏，水(灌溉水)、土(土壤)、气(空气)没有受到污染。其次是两者的产后(包括采收后的洗涤、整理、包装、加工、运输、贮藏、销售等环节)没有受到二次污染。
不同点:有机蔬菜在生产过程中不使用化肥、农药、生长调节剂等化学物质，不使用基因工程技术，同时还必须经过独立的有机食品认证机构全过程的质量控制和审查，允许使用有机肥料，主要用于基肥。不用化学农药，而用防虫网或生物农药及其他非化学手段防治病虫害。而无公害蔬菜是不用或少用化肥和化学农药，其产品的残留量经测定在国家规定范围内的称绿色无公害蔬菜。
有机蔬菜也是无公害蔬菜，而无公害蔬菜不一定是有机蔬菜。
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